Det har stormat kring Polygiene under den senaste tiden. I en artikel i Sydsvenskan i påskas anklagades bolaget för att sälja giftiga produkter. Svenskt Vatten menade bland annat att silverklorid som finns i Polygienes produkter förorenar vattnet när kläder som är behandlade med bolagets teknik tvättas. Ulrika Björk, Polygienes vd, tillbakade kritiken i media.